Table 2 |
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| a: Summary of the selected candidate genes' microarray data (/stands for no value). |
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| Microarray Probeset |
201167_x_at |
201168_x_at |
210538_s_at |
202014_at |
203725_at |
200799_at |
200800_s_at |
202581_at |
214786_at |
205192_at |
201502_s_at |
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| Gene Symbol SLR = log2(RQ) |
ARHGDIA |
ARHGDIA///LOC728908 |
BIRC3 |
PPP1R15A/Gadd34 |
GADD45A |
HSPA1A |
HSPA1A///HSPA1B |
HSPA1B |
MAP3K1 |
MAP3K14 |
NFKBIA |
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| Ta+TR vs Ko_SLR |
-0,74 |
/ |
-1,45 |
1,55 |
1,46 |
2,54 |
3,28 |
2,45 |
-0,04 |
/ |
2,47 |
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| TR50 vs Ko_SLR |
1,19 |
0,43 |
/ |
/ |
/ |
/ |
/ |
/ |
/ |
/ |
1,17 |
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| Ta250 vs Ko_SLR |
-0,55 |
-0,28 |
/ |
0,95 |
1,33 |
2,49 |
2,99 |
2,06 |
/ |
-1,35 |
2,03 |
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| Ta+TR vs TR50_SLR |
-1,95 |
-2,32 |
1,22 |
1,55 |
2,61 |
2,96 |
2,44 |
-1,32 |
-1,34 |
1,3 |
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| Ta+TR vs Ta250_SLR |
/ |
0,49 |
/ |
0,61 |
/ |
/ |
0,25 |
0,43 |
/ |
/ |
0,45 |
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| b: Summary of the selected candidate genes' rtPCR data. The correlation with the findings of the microarray is high except for ARGHGDIA. |
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| Taqman assay |
Hs00976924_g1 |
Hs00154109_m1 |
Hs00169585_m1 |
Hs00169255_m1 |
Hs00359163_s1 |
Hs01040501_+sH |
Hs01089753 |
Hs00394890_m1 |
Hs00153283_m1 |
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| Gene Symbol SLR = log2(RQ) |
ARGHGDIA |
BIRC3 |
GADD34 |
GADD45A |
HSPA1A |
HSPA1B |
MAP3K14 |
MAP3K1 |
NFKBIA |
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| TA+Tr vs Control |
-0,4205 |
-1,1638 |
1,2819 |
2,4504 |
3,8893 |
3,1561 |
-0,8706 |
-0,5410 |
2,3151 |
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| TR50 vs Control |
-0,1207 |
1,1527 |
0,2107 |
0,7523 |
0,4395 |
0,4545 |
0,1833 |
0,0203 |
1,5287 |
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| TA25 vs Control |
0,0120 |
-0,3926 |
1,4327 |
2,8888 |
3,6653 |
3,5939 |
-0,7547 |
-0,1194 |
2,5517 |
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| TA+Tr vs TR50 |
-0,2998 |
-2,3165 |
1,0712 |
1,6981 |
3,4498 |
2,7016 |
-1,0539 |
-0,5613 |
0,7864 |
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| TA+Tr vs TA25 |
-0,4325 |
-0,7712 |
-0,1508 |
-0,4385 |
0,2240 |
-0,4378 |
-0,1159 |
-0,4217 |
-0,2366 |
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Daigeler et al. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 2008 27:82 doi:10.1186/1756-9966-27-82 |
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